Padova possiede un piccolo aeroporto (l'Allegri) abilitato ai voli executive (importanti per le imprese dell'area) mentre i voli di linea, passeggeri e cargo, sono attivati negli aeroporti di Venezia, Treviso, Verona.

L'aeroporto di Venezia dista 40 Km da Padova, quello di Verona 80 Km, quello di Treviso 35 Km. Il completamento del sistema ferroviario metropolitano renderà agevole il raggiungimento da Padova dell'aeroporto di Venezia, attualmente il terzo d'Italia per movimento di passeggeri.

Di recente è stato rinnovato su una superficie complessiva di mq. 60.000, adatto per accogliere fino 6,5 milioni di passeggeri.
Dotato dei più moderni apparati tecnologici per la gestione della comunicazione dati, dei sistemi di sicurezza all'avanguardia e di spazi commerciali adeguati agli alti volumi di traffico.